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Pandas to_csv()函数保存2000万条记录的大数据帧耗时过长,如何优化?

聖光之護
发布: 2025-03-05 09:26:18
原创
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pandas to_csv()函数保存2000万条记录的大数据帧耗时过长,如何优化?

Pandas to_csv() 函数处理大型数据集时速度缓慢?本文提供优化方案,解决将2000万条记录、100列数据保存为CSV文件耗时过长的问题。

问题:使用 to_csv() 函数保存包含约2000万条记录的大型 Pandas DataFrame,耗时高达55分钟。即使使用了 chunksize 参数分块写入,效果仍然不理想。

原始代码片段:

import os
import glob
import pandas as pd

src_files = glob.glob(os.path.join('/my/path', "*.csv.gz"))

# 读取数据
for file_ in sorted(src_files):
    stage = pd.DataFrame()
    iter_csv = pd.read_csv(file_, sep=',', index_col=False, header=0, 
                           low_memory=False, iterator=True, chunksize=100000, 
                           compression='gzip', memory_map=True, encoding='utf-8')

    df = pd.concat([chunk for chunk in iter_csv])
    stage = stage.append(df, ignore_index=True)

# 写入数据
stage.to_csv('output.csv', sep='|', header=True, index=False, 
             chunksize=100000, encoding='utf-8')

del stage
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虽然代码已采用分块读取和写入,但 to_csv() 函数处理大规模 CSV 文件的效率仍然较低。

解决方案:使用 Pandas 的 to_hdf() 函数将数据保存为 HDF5 格式。HDF5 是一种高效的二进制数据格式,显著提升读写速度。

优化代码:

stage.to_hdf(r'path/file.h5', key='stage', mode='w')
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将数据保存为 HDF5 格式后,写入时间将大幅缩短。to_hdf() 函数在处理大型数据集时具有显著的性能优势,是处理此类问题的有效解决方案。 选择合适的路径和文件名替换 r'path/file.h5'。 请确保已安装 pytables 库,它是 to_hdf() 函数的依赖。 如果未安装,可以使用 pip install tables 命令安装。

以上就是Pandas to_csv()函数保存2000万条记录的大数据帧耗时过长,如何优化?的详细内容,更多请关注php中文网其它相关文章!

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