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解决Pandas DataFrame碎片化导致的性能警告

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发布时间:2025-08-12 17:12:31

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来源于php中文网

原创

解决pandas dataframe碎片化导致的性能警告

本文旨在解决在使用Pandas DataFrame时遇到的“DataFrame is highly fragmented”性能警告。该警告通常由于频繁使用frame.insert等操作导致DataFrame内存不连续。本文将介绍产生此警告的原因,并提供使用pd.concat等方法优化代码的方案,以提升DataFrame操作的效率。

Pandas DataFrame在数据处理中被广泛使用,但当频繁地向DataFrame中插入列时,可能会遇到PerformanceWarning: DataFrame is highly fragmented的警告。这意味着DataFrame的内存布局变得不连续,导致后续操作效率降低。以下将深入探讨此问题并提供解决方案。

问题分析

DataFrame碎片化通常是由于以下原因造成的:

  • 频繁插入列: 使用frame.insert或直接赋值df['new_column'] = ...多次添加列。
  • 原地修改数据: 对DataFrame进行大量的原地修改操作。

这些操作会导致DataFrame的底层数据存储结构发生变化,产生不连续的内存块,从而降低性能。

解决方案:使用 pd.concat

避免DataFrame碎片化的关键在于避免频繁的列插入操作。pd.concat函数提供了一种更有效的方式来合并DataFrame,它可以在水平或垂直方向上连接多个DataFrame,从而避免了逐列插入的低效操作。

示例:

假设我们有一个DataFrame df,并且想基于df的某些列计算出新的列,并将这些新列添加到df中。

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import pandas as pd

# 示例DataFrame
df = pd.DataFrame({f"col{i}": [0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9] for i in range(3)})
print("Original DataFrame:")
print(df)

# 错误示例:频繁插入列
new_df = pd.DataFrame()
for i in range(3):
    new_df[f"new_df_col{i}"] = df[f"col{i}"] + i
print("\nDataFrame created with frequent insertions:")
print(new_df)

# 正确示例:使用pd.concat
data = {}
for i in range(3):
    data[f"new_col{i}"] = df[f"col{i}"] + i

new_df = pd.concat(data.values(), axis=1, ignore_index=True)
new_df.columns = data.keys()

print("\nDataFrame created with pd.concat:")
print(new_df)

# 将新列合并到原始DataFrame
df = pd.concat([df, new_df], axis=1)
print("\nDataFrame after concatenation:")
print(df)

代码解释:

  1. 错误示例: 代码使用循环和直接赋值的方式,逐列向new_df中插入数据,这会导致DataFrame碎片化。
  2. 正确示例: 首先,创建一个字典 data,用于存储新列的数据。然后,使用 pd.concat 函数将字典中的所有列一次性合并成一个新的DataFrame new_df。 axis=1表示沿水平方向(列)连接,ignore_index=True表示忽略原始索引,生成新的连续索引。 最后,为新生成的DataFrame指定列名。
  3. 合并到原始DataFrame: 使用pd.concat将包含新列的new_df与原始DataFrame df合并。

原问题代码优化:

根据原问题中的代码,可以进行如下优化:

# 原始代码
# df[self.listsunigram] = pd.DataFrame(df.xcount.tolist(), index=df.index)

# 优化后的代码
df = pd.concat(
    [df, pd.DataFrame(df.xcount.tolist(), index=df.index, columns=self.listsunigram)],
    axis=1,
)

对其他类似的代码片段也进行相同的优化。

注意事项

  • 内存占用 pd.concat 会创建新的DataFrame,因此可能会占用更多的内存。在处理大型数据集时,需要注意内存使用情况。
  • 性能权衡: 虽然pd.concat可以避免DataFrame碎片化,但在某些情况下,如果只需要添加少量列,直接赋值可能更简单高效。需要根据实际情况进行权衡。
  • 数据类型: 确保要连接的DataFrame的数据类型一致,避免出现类型转换导致的问题。

总结

通过避免频繁的列插入操作,并使用pd.concat等方法,可以有效地解决Pandas DataFrame碎片化问题,提升数据处理的效率。在编写代码时,应尽量采用批量操作的方式,减少对DataFrame结构的频繁修改。

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