在《创意咖啡店物语》中，制作类技能对经营效率至关重要。首推“咖啡大师”，这是吧台员工的核心技能，可显著提升饮品的品质评分，当技能升至三星时，还能解锁如开罗生姜等隐藏配方，极大丰富菜单内容。其次是“甜点专家”，前期非常实用，能加快蛋糕与甜品的制作速度达25%，但会带来5%的原料消耗增加；若搭配“节约用料”技能使用，则可在提速的同时抵消材料损耗，实现高效产出。最后是“快速烹饪”，作为后厨的关键技能，它无资源消耗且大幅提升出餐速度，但连续使用会导致失误率逐渐上升，需合理安排使用节奏。
服务类技能直接影响顾客体验、店铺口碑和营收表现。“微笑服务”能有效减缓顾客等待时耐心值的下降速度，特别适合用于午餐或下午茶等人流高峰时段。“魅力沟通”有10%的概率促使顾客进行额外消费，从而提高单客收益，不过该效果对“赶时间上班族”这类特殊顾客无效。“高效清洁”则专注于提升清理餐桌的速度，保障翻台效率；而“大力”技能可增强服务成功率与整体操作效率，减少服务失败带来的负面反馈。
技能升级需要消耗技能书和金币。建议优先将“咖啡大师”升至3级，以尽早解锁隐藏配方，提升品鉴会竞争力，快速获取资源。之后可重点培养“快速烹饪”，进一步优化出餐流程。服务方面推荐先升级“微笑服务”稳定客流，后期再补充“魅力沟通”提升收入。清洁类技能只需点到1级即可满足基本需求，过度投入回报较低。初期推荐配置为：1名拥有“咖啡大师”的吧台员、1名掌握“快速烹饪”的后厨员以及1名具备“微笑服务”的服务员，足以支撑6张桌子的日常运营。但当中后期店铺扩展至10桌以上时，必须至少配备2名拥有“高效清洁”技能的员工，防止餐桌积压，确保高入座率。需要注意的是，技能等级不可超过角色自身等级，且每次升级后会有冷却时间，因此建议避开营业高峰期进行技能提升，兼顾收益与成长。
