PDO不支持绑定数组。
要么别用绑定了，

$ids = array(2344, 5523, 9332);
// 过滤ids略
$in = implode(',',$ids); 
$st = $pdo->prepare('SELECT * FROM table_name WHERE id IN ('.$in.')');
$st->execute();

如果你坚持用绑定或许只能这样

$ids = array(2344, 5523, 9332);
// 自动构造多个?号略
$st = $pdo->prepare('SELECT * FROM table_name WHERE id IN (?,?,?)');
foreach ($ids as $k => $id)
    $st->bindValue(($k+1), $id);
$st->execute();

上午刚说过这个问题，PDO不支持这种绑定，参见：
http://segmentfault.com/q/10100000001... 第三条。

08年写lotusphp的文档时专门标注了，PDO不支持这个，楼上zhao yi也是lotusphp开发者

PDO是不支持这种绑定的，但是可以通过第三方的Class来实现，这个是我做的一个PDO Class，可以实现安全的WHERE IN，而且使用也方便。

https://github.com/lincanbin/PHP-PDO-MySQL-Class
使用方法也很简单，先new一个对象

<?php
define('DBHost', '127.0.0.1');
define('DBName', 'Database');
define('DBUser', 'root');
define('DBPassword', '');
require(dirname(__FILE__)."/src/PDO.class.php");
$DB = new Db(DBHost, DBName, DBUser, DBPassword);
?>

然后

<?php
$DB->query("SELECT * FROM fruit WHERE name IN (?)",array('apple','banana'));
?>

即可，其他的SQL语法使用可以看https://github.com/lincanbin/PHP-PDO-MySQL-Class

可以参考下，首先遍历构造几个问号，然后绑定参数

  public function getMdtInfoByMdtID($mdtID)
    {
        $in = '';
        foreach ($mdtID as $value) {
            $in .= '?,';
        }
        $in = rtrim($in, ',');
        $sql = 'select * from ' . $this->tableName . ' where MdtID in (' . $in . ')';
        $st = self::$handle->prepare($sql);
        $st->execute($mdtID);
        return $st->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);

    }