这不是作用域的问题，是变量声明提升，sf上类似的问题和文章也有很多。

结果没有任何问题，楼上说的对，这是一个变量声明提升的问题，通过var声明的变量会提升，但是赋值却会按顺序来，第二段那个var a覆盖了全局作用域里的var a=1，在执行第一个alert（a）时，函数里的a被声明了，却没来得及赋值当然就是undefined

变量提升的问题
第二段代码相当于

var x=1;
$(document).ready(function(){
var x;
alert(x);
x = 2;
alert(x)

})
第一个alert的x定义了但是没有值
这样可以看得清楚了吧

就是一个简单的变量提升问题，可以看看这篇文章：
JavaScript变量提升

个人觉得其实这个本质是作用域或者namespace的问题，因为js编译期函数里面对x的赋值就确定了x在函数内部的namespace里面，而alert(x)
的时候，却发现没有赋值，因此就是undifined， 而如果直接alert(x)， 没有赋值就不会在函数的namespace里面放入x， 而是去找其它作用域的， 于是找到最外面的x，因此可以输出。