这种情况可以使用面向对象的思想去管理，每一组p button1 button2 都看成一个Button对象
将操作行为封装在对象里面。每次点击按钮都创建一个对象就可以了

function Button(p, button1, button2) {
      this.p = p;
      this.button1 = button1;
      this.button2 = button2;
      this.init();
  }
  Button.prototype.init = function() {
      var _this = this
      this.button2.onclick = function() {
          _this.changeHeight(100)
      }
      this.button1.onclick = function() {
          _this.changeWidth(200)
      }
  }
  Button.prototype.changeHeight = function(height) {
      console.log(height)
      this.p.style.height = height + 'px'
  }
  Button.prototype.changeWidth = function(width) {
      this.p.style.width = width + 'px'
  }

在这个地方创建对象

body.appendChild(button2); //把p和两个按钮插入进文档
      new Button(p, button1, button2)
      // code...
      // 我想点击按钮改变p相应的样式...

给按钮加自定义属性，给p加类名或者id类似于这样

...
 let nth = 0;
    btn.onclick = function(){
        p = document.createElement("p");
        p.className = 'p'+nth;//加标示
        button1 = document.createElement("button");
        button2 = document.createElement("button");// 创建p和两个按钮
        button1.innerHTML = "change With";
        button2.innerHTML = "change Height"; // 设置两个按钮的内容
        button1.setAttribute('data-nth','p'+nth);//加相同标示
        button2.setAttribute('data-nth','p'+nth);//加相同标示
        //把p和两个按钮插入进文档
        nth++;
        // code...
        // 我想点击按钮改变p相应的样式...
        改变的时候就读取按钮上的data-nth属性，查找对应的p进行操作
    }

你也可以通过其他方式加标示
//也可以将p存在button的一个属性上

button1.target = p;
button2.target = p;
button1.onclick = function(){console.log(this.target)};
//不过这么存的多了可能挺占内存的 

另一个更简单的方式，定义一个数字，每次点击new p时，调用一个函数跟随num值增加，实现你要的功能，希望有帮到你

var body = document.querySelector("body");
    var btn = document.querySelector("button"); // 获取body和按钮
    var num=0;
    btn.onclick = function(){
        p = document.createElement("p");
        p.className='p'+num;
        button1 = document.createElement("button");
        button1.className='button'+num;
        button2 = document.createElement("button"); // 创建p和两个按钮
        button2.className='button'+num;
        button1.innerHTML = "change With";
        button2.innerHTML = "change Height"; // 设置两个按钮的内容
        body.appendChild(p);
        body.appendChild(button1);
        body.appendChild(button2); //把p和两个按钮插入进文档
        
        get();
        num++;
    };
    function get(){
        var p=document.getElementsByClassName('p'+num)[0];
        var aBtn1=document.getElementsByClassName('button'+num);
        aBtn1[0].onclick=function(){         //第一个button按钮
            p.style.width='300px';
        };
        aBtn1[1].onclick=function(){        //第二个button按钮
            p.style.height='300px';
        }
    }