Python2和3的糊涂账……

最早的时候，只有open。
你知道的，Python 2的编码多么蛋疼，所以，就有了codecs.open.

至于io.open，其实是因为Python 2的open实际上是file模块提供的，而Python 3的open是io模块提供的。然后，Python 2.6引入了这个Python 3的特性，叫做io.open，以便和原来的open相区分。

但是，这个Python 2.6的io.open是有问题的，在一些情况下表现很怪异。Python 2.7的io.open就正常了。

个人建议：

Python3直接用open。
Python2.x下用codecs.open，特别是有中文的情况，然后也可以避免踩到2.6下面io.open的坑。
如果希望代码同时兼容Python2和Python3，那么推荐用codecs.open。

关于codecs.open废弃的讨论……这个，我只能说，虽然有PEP 404，但是还是有人想要Python 2.8，Python 3都出来这么久了，但是实际采用率呢？未来的事情谁也说不准。