请参考我在知乎上的一个回答：

http://www.zhihu.com/question/20393785/answer/30725725

每一步都有截图。

当然，那是完全不用命令行的办法，其实我还是更推荐命令行，流程如下：

1. 首先要先确定一下是否建立了主repo的远程源：

   git remote -v
   

2. 如果里面只能看到你自己的两个源(fetch 和 push)，那就需要添加主repo的源：

   git remote add upstream URL
   git remote -v
   

   然后你就能看到upstream了。

3. 如果想与主repo合并：

   git fetch upstream
   git merge upstream/master
   

简单的操作就是在Github建立一个A账号某Repo下的Pull Request然后目标是B的源码，然后最后同意然后merge

当然如果熟悉comment line的话楼上说的也可以。其实道理是一样的

好像还没有全自动的办法