需合并PDF图层时，一可用Acrobat Pro DC的图层面板右键“合并所选图层”；二可通过打印为Adobe PDF并勾选“压平透明度和图层”实现；三可使用pdfcpu命令行工具执行flatten -mode=ocg。
如果您的PDF文档中包含多个图层，而需要将这些图层统一为单一平面内容以便打印、导出或兼容性处理，则需执行图层合并操作。以下是实现该目标的具体方法：
一、使用Adobe Acrobat Pro DC合并图层
Adobe Acrobat Pro DC支持对PDF中嵌入的图层（通常源自AutoCAD、Illustrator或InDesign等专业软件导出的PDF）进行可视化管理与合并。该方法直接调用原生图层控制功能，确保结构完整性。
1、启动Adobe Acrobat Pro DC，打开含图层的PDF文档。
2、点击右侧工具栏中的“组织页面”工具，若未显示，可依次点击“工具”→“组织页面”启用。
3、在右侧面板中查找并点击“图层”选项卡；若无此选项，说明当前PDF不含OCG（Optional Content Group）图层，无法执行图层级操作。
4、在图层面板中，右键单击任意图层名称，在弹出菜单中选择“合并所选图层”；如需全部合并，先按住Ctrl键（Windows）或Command键（macOS）逐个点击图层以多选，再右键执行合并。
5、确认合并后，图层面板中仅保留一个默认图层，且所有视觉内容已叠加渲染为不可分离的位图/矢量混合对象。
二、通过Acrobat打印功能强制压平图层
当图层面板不可见或“合并所选图层”选项呈灰色不可用时，表明图层可能被锁定、嵌套过深或PDF版本不支持交互式图层控制。此时可利用虚拟打印机制实现逻辑合并，即输出为无图层的新PDF。
1、在Acrobat中打开目标PDF，按下Ctrl+P（Windows）或Command+P（macOS）调出打印对话框。
2、在打印机名称下拉菜单中选择“Adobe PDF”（需已安装Acrobat配套虚拟打印机）。
3、点击“属性”或“首选项”按钮，进入打印设置界面。
4、在“Adobe PDF设置”选项卡中，勾选“创建符合PDF/A-1b标准的文件”或“压平透明度和图层”（具体文字依Acrobat版本略有差异）。
5、点击“确定”返回打印对话框，再点击“确定”开始生成新PDF；生成后的文件将不再包含可识别图层结构。
三、使用命令行工具pdfcpu执行图层压平
pdfcpu是一款开源PDF处理工具，支持在无图形界面环境下批量处理图层。其“flatten”子命令可移除OCG图层定义，并将所有可见内容渲染至基础内容流，适用于自动化流程或服务器端操作。
1、从官方GitHub仓库下载对应平台的pdfcpu二进制文件，并将其路径加入系统环境变量。
2、打开终端（macOS/Linux）或命令提示符（Windows），输入命令：pdfcpu flatten -mode=ocg input.pdf output.pdf。
3、等待命令执行完成，检查output.pdf是否仍可在Acrobat图层面板中展开；若面板为空或提示“无图层”，则表示压平成功。
4、如遇权限错误，可在命令前添加sudo（macOS/Linux）或以管理员身份运行命令提示符（Windows）。
