Quarto 文档间图表交叉引用:利用 include 实现内容整合

花韻仙語
发布: 2025-09-24 10:02:01
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Quarto 文档间图表交叉引用:利用 include 实现内容整合

本文探讨在 Quarto 独立文档中实现跨文件图表交叉引用的方法。由于 Quarto 默认的交叉引用机制仅限于单一编译单元,直接引用外部文件中的标签无法成功。核心解决方案是利用 {{< include >}} 短代码将包含图表定义的 .qmd 文件内容嵌入到主文档中,从而使所有引用标签在渲染时处于同一上下文,实现准确的交叉引用。

理解 Quarto 的交叉引用机制

quarto 提供了强大的交叉引用功能,允许用户轻松引用文档中的图表、表格、章节、方程式等元素。这些引用通过 @label 的形式实现,quarto 在渲染时会自动替换为相应的编号和链接。然而,quarto 的默认交叉引用机制主要作用于一个编译单元内部。这意味着,如果一个图表 (#fig-a) 定义在一个独立的 .qmd 文件中,而另一个 .qmd 文件试图直接引用它,quarto 的渲染引擎将无法在当前编译上下文中找到该标签,从而导致引用失败。

对于像 Quarto Book 这样的多文件项目,其内部有特定的机制来管理跨章节的引用。但在处理两个独立的、非项目关联的 .qmd 文件时,我们需要一种不同的策略来“合并”它们的上下文。

跨文档引用图表的挑战

考虑以下场景:您有一个主文章 article.qmd,希望引用一个定义在 _annex.qmd 文件中的图表。

article.qmd (尝试引用外部图表):

参见附录中的图 @fig-a 以获取详细信息。
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_annex.qmd (定义图表):

![图表的标题](path/to/figure.png){#fig-a}
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如果直接编译 article.qmd,Quarto 将无法解析 @fig-a,因为它在 article.qmd 的本地上下文中并不存在。

解决方案:利用 include 短代码

解决这个问题的关键在于 Quarto 的 include 短代码。{{< include filename.qmd >}} 允许您将一个外部文件的内容直接嵌入到当前文档中,就好像这些内容本来就在当前文档一样。当 Quarto 渲染主文档时,它会首先将所有 include 指令替换为相应文件的实际内容,然后才进行后续的解析和编译。

通过这种方式,定义在 _annex.qmd 中的图表及其标签 (#fig-a) 将在渲染 article.qmd 时被有效地拉入 article.qmd 的编译上下文,从而使交叉引用能够正确解析。

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实施步骤

  1. 准备包含图表的 .qmd 文件 (例如 _annex.qmd): 创建或修改您的附录文件,确保图表带有唯一的标签。通常,为了表明这是一个被包含的文件,我们会在文件名前加上下划线(例如 _annex.qmd),但这并非强制要求。

    _annex.qmd:

    ---
    title: "附录A:示例图表"
    ---
    
    这是一个在附录中定义的示例图表。
    
    ![Quarto Logo 示例图](https://quarto.org/quarto.png){#fig-a width="300"}
    
    图 @fig-a 展示了 Quarto 的 Logo。
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    注意:_annex.qmd 内部可以包含完整的 Markdown 内容,包括 YAML 头,但通常为了被包含,我们会省略 YAML 头或只保留必要的元数据。

  2. 在主文档中引用并包含附录文件 (例如 article.qmd): 在您希望引用图表的主文档中,使用 {{< include >}} 短代码将 _annex.qmd 的内容引入。通常,您会将附录内容放在主文档的末尾,或者在适当的章节。

    article.qmd:

    ---
    title: "我的 Quarto 文章"
    format: html
    ---
    
    # 引言
    
    本文将探讨 Quarto 的一些高级功能。
    
    # 内容
    
    我们在附录中提供了一个详细的示例图。参见附录中的图 @fig-a 以获取详细信息。
    
    # 结论
    
    Quarto 的 `include` 功能非常实用。
    
    # 附录
    
    {{< include _annex.qmd >}}
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  3. 编译主文档: 使用 Quarto 编译 article.qmd。

    quarto render article.qmd
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    编译完成后,article.qmd 生成的 HTML、PDF 或其他格式文档中,@fig-a 将被正确解析为图表的编号和链接。

机制详解与注意事项

  • 编译流程: 当 article.qmd 被渲染时,Quarto 会在处理 Markdown 内容之前,将 {{< include _annex.qmd >}} 替换为 _annex.qmd 的全部内容。这意味着,在 Quarto 的交叉引用解析阶段,#fig-a 标签已经存在于 article.qmd 的“虚拟”文档树中,因此可以被成功引用。
  • 文件命名约定: 习惯上,被 include 的文件通常以 _ 开头(例如 _partial.qmd),这表明它们是局部文件,不应被独立渲染。这有助于组织项目结构。
  • 路径问题: include 短代码中的文件路径是相对于当前 .qmd 文件的。如果被包含的文件在子目录中,需要提供正确的相对路径。
  • 重复标签: 尽管 include 使得跨文件引用成为可能,但最终所有内容都合并到一个文档中。因此,所有标签(图表、表格、章节等)在合并后的文档中必须是唯一的。如果 article.qmd 和 _annex.qmd 都定义了 #fig-a,将会导致冲突。
  • 代码块包含: include 不仅限于 Markdown 内容,也可以用于包含代码块。例如,{{< include my_code.R >}} 可以将 R 脚本文件内容作为代码块嵌入。
  • 替代方案(Quarto Book/Project): 对于大型、多章节的项目,Quarto Book 或 Quarto Project 提供了更高级的结构化方式和跨章节引用机制,它们是为管理大量文件而设计的。本文介绍的 include 方法更适用于在非项目结构下,需要将特定内容块从外部文件拉入主文档的场景。

总结

在 Quarto 中实现跨独立文档的图表交叉引用,不能依靠 Quarto 默认的“外部”引用机制。核心的解决方案是巧妙地利用 {{< include >}} 短代码。通过将包含图表定义的 .qmd 文件内容嵌入到主文档中,我们有效地将所有相关的标签带入同一个编译上下文,从而使 Quarto 的交叉引用功能能够无缝工作。这种方法提供了一种灵活且强大的方式来模块化您的 Quarto 文档内容,同时保持完整的引用能力。

以上就是Quarto 文档间图表交叉引用:利用 include 实现内容整合的详细内容,更多请关注php中文网其它相关文章!

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