XML数据库专用于存储XML数据，采用树状结构保留层次关系；相比关系型数据库的固定表结构，它支持灵活的半结构化数据；适合处理嵌套复杂的数据类型；查询使用XPath/XQuery而非SQL。
XML数据库是专门用来存储、查询和管理XML格式数据的系统，它能完整保留XML文档的层次结构、标签和属性。与传统关系型数据库相比，它的核心区别在于数据模型：XML数据库采用树状或层次化结构，而关系型数据库使用固定的表格行列结构。
关系型数据库要求预先定义严格的表结构（Schema），所有数据都必须符合这个模式。一旦需要新增字段或改变结构，往往涉及修改表定义，过程比较繁琐。
XML数据库则天然支持半结构化数据。它的数据模型本身就是灵活的树形结构，可以轻松容纳不同结构的文档。即使在同一个数据库里，每个XML文件也可以有不同的元素和层级，添加新数据项只需更新文档本身或其模式定义，无需重构整个数据库。
关系型数据库最擅长处理高度结构化的数据，比如用户信息、订单记录等，这些数据通常规整地分布在多张关联的表中。
XML数据库特别适合存储那些结构不固定、有复杂嵌套或层级关系的数据。例如，产品配置说明、科研数据、复杂的配置文件或内容管理系统中的文章，这些数据用XML的标签能更自然地表达其内在联系。
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查询关系型数据库主要用SQL，通过SELECT语句从表中提取数据，重点是基于值的检索和多表连接。
XML数据库则使用专为层次化数据设计的查询语言，如XPath和XQuery。你可以用它们沿着树的路径查找特定节点，或者根据元素的层级关系和顺序进行查询，操作更贴近于“遍历”文档结构。
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